본 발명은 서열번호 1 및 2의 프라이머 쌍 및 서열번호 3 및 4의 프라이머 쌍으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 프라이머 쌍을 포함하는 무의 위황병 저항성 검출용 프라이머 세트 및 이를 이용한 무의 위황병 저항성 선발 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 무의 위황병 저항성 검출용 프라이머 세트는 위황병 저항성과 이병성에 있어 염기서열의 차이를 나타낼 수 있는바, 외부의 선발 조건에 영향을 받지 않고, 안정적으로 무의 위황병 저항성 품종을 검출, 선발 또는 육성하는데 유용할 뿐만 아니라, 저항성 품종을 분리하여 새로운 품종을 개발하는데도 유용하게 이용될 수 있을 것으로 기대된다. 또한, 위황병으로 인한 무 작물의 수율 손실 및 상품성이 저하되는 것을 방지할 수 있어 농가의 수입을 증가시키는데도 유용할 것으로 기대된다.